Potrebbe trattarsi di un bug dovuto al tuo sistema operativo Win 8.1 con Foto Su DVD MX, che è un programma un po' passato.
Se facendo i tagli ti provoca il problema di sincronia, dovresti scomporre il video dall'audio, e manualmente sincronizzarlo, chiaramente devi lavorare in Timeline, e zoomare la timeline in modo da vedere bene la forma d'onda. Per tanto se l'audio arriva in ritardo, sposti la forma d'onda verso sinistra di qualche frame fin quando non trovi la posizione giusta, se l'audio è in anticipo la sposto verso destra. Tieni presente che dovrai fare alcune prove, quindi munisciti di pazienza.