Il y a longtemps que je ne me sert plus de ce logiciel (d'ailleurs très peu servi ). Si j'ai bien compris votre problème, il me semble qu'il vaudrait mieux faire un détourage de l'image avec le lasso et enregistrer au format png, de cette façon vous aurez la transparence.
Une exportation d'un fichier image PNG, s'accompagne presque toujours d'un onglet Paramètres présent dans le bas de la fenêtre de l'explorateur de fichiers. Dans les paramètres, un onglet Options dans lequel on peut cocher la transparence du fond.