Ja, das ist möglich. Du musst nur darauf achten, dass du nur eine index.htm hast.
Dann legst du einfach ein neues Projekt an, schneidest die nächste Seite im ersten Projekt aus und fügst das Ausgeschnittene im zweiten Projekt ein. So machst du mit der dritten und allen weiteren Seiten weiter. Achte aber darauf, dass die erste Seite in den neuen Projekten einen eindeutigen Namen hat (nicht index!!) und dass du natürlich dann speicherst. Beim Export bzw. Veröffentlichen immer das gleiche Verzeichnis benutzen. Dann solltest du mehrere Dateien mit der Endung .HTM und mehrere unterschiedliche Versichnisse haben.