Dein Problem lässt sich sicher schnell klären.

Allerdings ist mir nicht so ganz klar geworden, was Du beabsichtigst.
Wenn Du mir den Unterschied zwischen "neues Fenster" und "zusätzliches Fenster" erklären kannst, finden wir aber bestimmt eine passende Lösung.

Ich vermute, dass Du bei dem Link über einen Button der NavBar, die Standardoption bei "Link öffnen in:" übernimmst. Das ist "Gleicher Frame (_self)"

Wenn Du die PDF Datei über einen Textlink öffnest, ist als Standardoption "Nicht angegeben" aktiviert. Das interpretiert der WD ebenfalls als "Gleicher Frame (_self)".

So, oder so sollte sich die verlinkte PDF Datei also in dem Fenster zeigen, in dem die aufrufende Seite angezeigt wurde, wenn Du an den Einstellungen nichts geändert hast...

Wenn Du möchtest, dass die PDF Datei in einem neuen, separaten Fenster (oder Tab) angezeigt wird, muss die o. a. Option also nur auf "Neues Fenster oder neuer Reiter (_blank)" eingestellt werden.

Wenn Du mehr wissen möchtest, gib mal im Index der Hilfedatei das Suchwort "Link" ein. Da werden die Zusammenhänge sehr detailliert erklärt.

Und wenn alles nicht hilft, melde Dich einfach wieder.

Viel Erfolg