[...] Binde ich es jedoch in meine bestehende Seite ein, läuft es nicht. [...]
Die korrekte Wiedergabe von MP4 Videos ist auch vom verwendeten Browser abhängig und sie ist davon abhängig, ob das Video online- oder lokal abgespielt wird.
Bei der online Wiedergabe hat ja auch der ausliefernde Server noch ein "Wörtchen" mit zu reden...
Probier's mal mit der Neucodierung, dann bist Du das Problem wahrscheinlich los.