OK:

Camera Sony:  16:9    100Mps   50Mbps

GOPRO    4:3    48 Fps    1920 x 1440

PC  Win 10 Pro   intel core  i3-2100    3.10 GHz   64 bit su X64

RAM  12 Gb       ATI Radeon  HD 3470

Camera Sony:  16:9    100Mps ??  50Mbps ( non ho capito 100Mps) e manca il formato e i Frame per secondo Fps es: 1920 x 1440 a 50 fps

GOPRO    4:3    48 Fps    1920 x 1440,  Mbps??  (qui mancano i Mbps o Kbps) manca il codec

immagino che tu abbia un portatile, il tuo Intel core i3 e un 2 core +2 thread = 4, non molto per elaborare video ad alta risoluzione, inoltre la scheda video non è al top, credo che sia inevitabile utilizzare 2 formati video diversi e avere problemi su uno dei due, questo dipende dalla performance del Pc/Laptop che si utilizza.
Video Deluxe è la versione 2015 o 2016, standard, Plus, o Premium

Sony  1920 x 1080   50p   velocità in bit  50 Mbps

Video DELUX MX PREMIUM Charge 1.0

Cmq il pc non è un portatile

Ok, con Video Deluxe MX Premium, che ti giri su Windows 10 è già una fortuna, è un programma a 32 bit del 2011/2012 e non dovrebbe essere compatibile con Windows 10, inoltre lavora sempre a 32 bit e non sfrutta più di 3,5 gb di ram. Comunque ti dico che è proprio la tua versione di VDL MX Premium che ha un motore interno piuttosto vecchio e ha i suoi limiti. Una differenza sostanziale sono state inserite dalla versione 2015 e ancor migliore è la versione 2016 che sfruttano a pieno Windows 10 a 64 bit.
Purtroppo in questo caso non posso aiutarti, posso consigliare di diminuire gli  FPS e portarli a 25, poi diminuire i Bitrate da 50Mbps a 8000 Kbps, inoltre convertire i file video in MXV tramite conversione multipla, tramite il menù FILE | CONVERSIONE MULTIPLA, e impostare il progetto utilizzando il Proxy automatico, in questo modo alleggerisci più del doppio il carico a computer, pur mantenedo un buon rapporto del filmato, e se non bastasse ancora portare la risoluzione da fullHD a HD (1280x720)