Specifico subito che non ho il tuo programma, ma dovrebbe esserci sul menù FILE | Coppia di sicurezza | con le varie modalità di salvataggio.
Se intendi fare una coppia del progetto e dai file contenuti in esso, selezioni " Coppia File e progetto in una cartella" oppure  se lo salvi in un CD/DVD selezioni "Masterizza progetto e file multimediali".
Se ti interessa solo il progetto senza i file "Foto o filmati e musica" allora salvi lo stesso progetto, inserendo un numero progressivo o una parola, esempio " Fiori 1.MPH oppure Fiori(Copia sicurezza).MPH, e lo metti in una cartella nominata ad esempio (Copie di sicurezza)

NB: io uso Video Deluxe, e si procede in questo modo, magari anche nel tuo software si procede allo stesso modo, considerato che sono programmi della Magix