SWF è il controllo del player, quindi con *.swf c'è allegato anche un codice html, un codice*.js, il filmato Mp4 e altro.
Quindi la risposta è si e no, nel senso che prima devi tramite FTP mettere la cartella contenenti "html,swf,jscrip,mp4 e altro" nel tuo Host (Spazio Web), poi in Website Maker devi mettere un collegamento ipertestuale alla cartella messa in precedenza tramite FTP.
ES: se la cartella che contiene SWF e tutto il resto ha il nome "Mio Video", il collegamento iper testuale sarà:
http://nome sito.it/Mio Video/documento.html
Chiaramente devi mettere il nome reale del documento html, che normalmente prende il nome del swf.
Se non vuoi fare tutti questi passaggi, poi semplicemente importare tramite Website Maker  solo il file Mp4, e inserirlo nella pagina, verrà creato un player in automatico, poi tu poi scegliere i vari modelli messi a disposizione, per la grandezza del player lo puoi ingrandire con il mouse come vuoi, senza esagerare, cercando di tenere la dimensione reale del filmato.