Beh la richiesta in realtà è abbastanza semplice, hai mai visto un film in DVD? c'è l'audio Italiano e quello Inglese, sono due tracce audio.
Il mio file di partenza è un mp4 avente doppia traccia audio, dal menu a tendina ad esempio di VLC si decide se ascoltarne una o l'altra.
Se faccio come mi hai consigliato, come giustamente hai detto, vanno a sovrapporsi e non è questo il risultato che voglio ottenere, ma bensì due tracce audio indipendenti.
La sola soluzione che mi viene in mente e esportare il filmato e le due tracce audio singolarmente e unire il tutto all'interno di un contenitor .mkv con l'ausilio di mkvmerge, ma come ho scritto sopra, il file di partenza è un .mp4 con le due tracce al suo interno.