Hola,

Cuando se exporta el proyecto y se publica no importa si se hace desde el programa o Filezilla, no es por esta razón que algunos elementos puedan salir descolocados.
Crear una página sin tener como base una plantilla requiere un profundo conocimiento del programa. Muchos de los problemas que se presentan tienen que ver con errores en la creación y no con aspectos técnicos internos del programa, por eso yo siempre soy partidario de basarse en una plantilla si no se conoce a la perfección el funcionamiento del programa y nociones avanzadas de diseño gráfico y de la coherencia de las estructuras de navegación..

Precisamente es importante publicar los proyectos para ver como reaccionan en diferentes ordenadores y dispositivos móviles y corregir desde el programa los errores que se puedan visualizar. La plantillas originales son muy ordenadas y muy sobrias, algo que yo personalmente prefiero. Aparte de esto se ven muy bien todos los dispositivos, ordenadores, móviles y tablets.

Te recomiendo revisar el proyecto ya que el aspecto que se obtiene de las páginas depende en gran parte en el diseño que tu le has dado.

Las plantillas sin editar me gustan mucho:

http://www.multimediacreativa.es/template/

http://go53zl.xara.hosting/hipsterbikes_en/index.htm

Tienen un aspecto moderno, ordenado y animado.

Un saludo,