Vegas Pro bietet ab der Version 13 eine umfassende 3D-Arbeitsweise. Das Programm kann nicht nur die meisten 3D-Formate (z. B. Cineform-Dateien) im- und exportieren, sondern enthält auch Werkzeuge zur Korrektur von Schnappschüssen oder falsch ausgerichteten 3D-Kameras.

Import
Um selber 3D-Material aufzunehmen, brauchen Sie eine 3D-Kamera (oder zwei Kameras an einem Sockel), die zwei Videostreams (je einen für das linke und rechte Auge) aufnimmt.
Die beiden Streams können als seperate Dateien oder als einzelne Datei gespeichert werden.

• Wenn Sie über geeignete 3D-Bilddaten verfügen, öffnen Sie Vegas Pro.
• Wählen Sie "File" > "Properties" und öffnen Sie das Menü "Stereoskopischer 3D-Modus". Wählen Sie dort die passende Einstellung.
• Importieren Sie den linken und den rechten Videostream auf separate Spuren in die Timeline.
• Klicken Sie mit rechter Maustaste auf das Bild im Vorschaufenster, wählen Sie im Dialog "Preferenzen für die Videovorschau" einen stereoskopischen 3D-Modus und klicken Sie auf "Übernehmen" und "OK". 
• Klicken Sie auf den ersten Videostream. Halten Sie die Strg-Taste gedrückt und klicken Sie auf den zweiten Videostream, um beide Streams zu markieren.
• Klicken Sie mit rechter Maustaste auf einen der markierten Streams und wählen Sie "stereoskopischen 3D-Subclip erstellen" aus dem Dropdown-Menü aus, um beide Streams zu kombinieren. Nun sollten Sie das 3D-Bild im Vorschaufenster und auf Ihrem sekundären Bildschirm sehen.

Export
Ein 3D-Projekt kann in den folgenden Varianten exportiert werden:

• gerendert als einzelner 3D-Video-Stream, als Side-By-Side 3D-Video oder als anaglyphisches 3D-Video in verschiedenen Formaten
• als Upload auf YouTube 3D
• gerendert als unabhängige Links-/Rechts-Videostreams
• gerendert als .iso-Datei 
• gebrannt auf BluyRay Disc mit VEGAS Pro oder DVD Architect Pro