Das Teilen, das sogenannte Splitting, ist zwar recht zeitaufwändig, macht aber für die Besucher Deiner Website keinen Unterschied. Es gibt also keine nachteiligen Effekte.

[...] Wenn ich sie geteilt habe fügt sie sich dann automatisch zusammen [...]

Ja, das tut sie, dafür sorgen die Links, die Du an den richtigen Stellen entsprechend setzt.

[...] Wird dann alles korekt angezeigt? [...]

Ja, da sich an der Struktur der einzelnen Seiten nichts ändert, wird alles so angezeigt, wie es vor dem Splitting war.

[...] Wie kann ich meine Website Teilen [...]

Lies Dir mal das Tutorial durch, das ich hier abgelegt habe. Ich bin sicher, dass Du Dein Problem damit vom Tisch ziehen kannst.

Viel Erfolg