Im Storyboard siehst Du nur die Clips, die auf Spur 1 liegen. Befindet sich ein Clip in einer höheren Spur, so wird er im Storyboard nicht angezeigt, überlagert aber die Anzeige im vorschaumonitor und später auch im gerenderten Film.
In diesen Fällen solltest Du in den Timelinemodus wechseln.