[...] Der Close-Button erscheint zwar, aber das PopUp verschwindet trotzdem sobald ich vom Menüpunkt runtergehe. [...]

Das liegt an einer schlecht durchdachten Programmierung der MouseOver Funktion beim Einblenden von popup Ebenen.
Ohne Eingriff in den HTML Code der fertigen Site kannst Du das nicht abstellen. Aber der Eingriff ist marginal und mit ein paar Mausklicks erledigt...

In der fertigen Seite suchst Du im HTML Code den <a Tag mit dem Befehl "javascript:xr_cpu(4)", mit dem die popup Ebene eingeblendet wird.
Der im Code gelb markierte Wert "4" ist abhängig von der Position der popup Ebene in der Seiten- & Ebenen-Galerie, er kann in Deinem Projekt also einen anderen Wert haben.

In dem gefundenen <a Tag suchst Du den Befehl "onmousemove="xr_mpo(this,4,0,event)"" und löschst den im Code rot markierten Buchstaben "o".
Auch in dem Code kann der gelb markierte Wert "4" bei Dir ein anderer sein...

Hier der beschriebene <a Tag als Screenshot:

Wenn Du den Tipp umsetzt, musst Du daran denken, die Änderungen im Code nach jedem Export/Veröffentlichung Deines Projekts zu erneuern, weil der WD ansonsten seine ("unschöne") Programmierung des MouseOver Effekts aktiviert...

Wenn Deine Site auch für Benutzer von Mobilgeräten gedacht ist, musst Du in jedem Fall den MouseOver Effekt für die popup Ebene noch durch den üblichen Klick Effekt ergänzen. Mobilgeräte haben nun mal keine Maus.

[...] Dann wollte ich noch fragen, ob es die funktion (lock) nicht mehr gibt [...]

Die gibt es schon noch, sie wird aber leider ausgehebelt, wenn Du die popup Ebene mit der MouseOver Funktion einblendest (s. o.).

Abhilfe schafft die o. a. Codeanpassung. Dann funktioniert auch die "lock" Funktion wieder.

Viel Erfolg